Análisis de datos moleculares con algunos programas filogenéticos y de genética de poblaciones


Objetivo de aprendizaje

El objetivo de este curso es brindar al alumno los conocimientos teóricos y prácticos para el uso de algunos programas de cómputo que le permitan analizar datos moleculares, principalmente secuencias genéticas (ADN) para poder responder preguntas en el ámbito de la sistemática molecular, la filogeografía y en general de la ecología molecular.


Contenido temático

1.- 1. Alineamiento de secuencias genéticas. Práctica: PhyDE, MEGA 7, MAFFT. 2. Modelos de sustitución de nucleótidos y selección de modelos. Práctica: jModelTest. 3. Métodos de distancia. 3.1. UPGMA, Neighbour-Joining. Práctica: MEGA 7. 4. Métodos probabilísticos. 4.1. Máxima Verosimilitud. Práctica: MEGA 7. 4.2. Inferencia Bayesiana. Práctica: MrBayes. 5. Métodos genealógicos. 5.1. Redes de haplotipos. Práctica: Network, PopArt. 6. Diversidad genética y estructura genética. 6.1. Diversidad genética. 6.2. Estructura genética. Práctica: DnaSP, Arlequin, MEGA 7.


Perfil de ingreso

Estudiantes en las áreas de sistemática molecular, biodiversidad, y otras afines.


Perfil de egreso

Al final del curso los estudiantes serán capaces de: 1. Generar y resolver preguntas filogenéticas y del ámbito de la ecología molecular. 2. Utilizar los programas de cómputo más importantes, usados en los estudios filogenéticos y de genética de poblaciones aplicados a la ecología molecular.


Instituciones participantes

El Colegio de la Frontera Sur.


Periodo de registro cerrado.
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Área académica organizadora

Departamento de Sistemática y Ecología Acuática - Zooplancton y Oceanografía

Organizadores e instructores


Alma Estrella García Morales

El Colegio de la Frontera Sur

Responsable

Alma Estrella García Morales

El Colegio de la Frontera Sur

Instructor