La vinculación es una de las funciones sustantivas de ECOSUR. Para llevarla a cabo, la Dirección de Vinculación parte de los productos generados por los proyectos de investigación y las otras actividades académicas institucionales, y los pone a disposición de usuarios regionales.

A través de talleres, cursos, diplomados y otras actividades docentes sustentadas en la experiencia y capacidad de investigadores y técnicos, la Dirección de Vinculación estructura y organiza eventos educativos que contribuyen al fortalecimiento de las capacidades locales de grupos de productores, dependencias gubernamentales u organizaciones civiles.

Participa también en diversos foros de análisis o de consulta relacionado con el quehacer de ECOSUR. Una parte importante de sus tareas consiste en apoyar de diversas formas el trabajo académico institucional (sistematización de experiencias, apoyo metodológico para el trabajo comunitario, organización de eventos académicos, etc.).

A la fecha, la Dirección de Vinculación participa también en el proceso de gestión, formalización y monitoreo de los proyectos académicos que acceden a recursos financieros externos. Tiene particular interés en promover la valorización adecuada del principal activo institucional: el conocimiento científico generado, requerido con frecuencia para orientar, asesorar o fundamentar las decisiones de dependencias públicas, organizaciones de productores u ONGs en la toma de decisiones relacionadas con el manejo sustentable de los recursos naturales.